Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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