Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Fcer1aP20489 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Fcer1aP20489 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Fcer1aP20489 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Fcer1aP20489 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
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Fcer1aP20489 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Fcer1aP20489 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Fcer1aP20489 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Fcer1aP20489 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Fcer1aP20489 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Fcer1aP20489 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Fcer1aP20489 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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