Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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PTPRAP18433 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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PTPRAP18433 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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