Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.7 ms