Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vstm4T1NXB5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vstm4T1NXB5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vstm4T1NXB5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vstm4T1NXB5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vstm4T1NXB5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vstm4T1NXB5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vstm4T1NXB5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vstm4T1NXB5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vstm4T1NXB5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vstm4T1NXB5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vstm4T1NXB5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vstm4T1NXB5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vstm4T1NXB5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vstm4T1NXB5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vstm4T1NXB5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vstm4T1NXB5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vstm4T1NXB5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vstm4T1NXB5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms