Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp18Q9WTV6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp18Q9WTV6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp18Q9WTV6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp18Q9WTV6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp18Q9WTV6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp18Q9WTV6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp18Q9WTV6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp18Q9WTV6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp18Q9WTV6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp18Q9WTV6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp18Q9WTV6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp18Q9WTV6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp18Q9WTV6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp18Q9WTV6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp18Q9WTV6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp18Q9WTV6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp18Q9WTV6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp18Q9WTV6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp18Q9WTV6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp18Q9WTV6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp18Q9WTV6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp18Q9WTV6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp18Q9WTV6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp18Q9WTV6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp18Q9WTV6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp18Q9WTV6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp18Q9WTV6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp18Q9WTV6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp18Q9WTV6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp18Q9WTV6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp18Q9WTV6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp18Q9WTV6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp18Q9WTV6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms