Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pcsk1nQ9QXV0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms