Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK3

Cabp5, Calcium-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp5Q9JLK3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cabp5Q9JLK3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp5Q9JLK3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp5Q9JLK3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp5Q9JLK3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp5Q9JLK3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp5Q9JLK3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp5Q9JLK3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cabp5Q9JLK3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cabp5Q9JLK3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cabp5Q9JLK3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cabp5Q9JLK3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cabp5Q9JLK3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cabp5Q9JLK3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cabp5Q9JLK3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cabp5Q9JLK3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cabp5Q9JLK3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms