Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc28a3Q9ERH8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc28a3Q9ERH8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc28a3Q9ERH8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc28a3Q9ERH8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc28a3Q9ERH8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc28a3Q9ERH8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc28a3Q9ERH8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc28a3Q9ERH8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc28a3Q9ERH8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc28a3Q9ERH8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc28a3Q9ERH8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc28a3Q9ERH8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc28a3Q9ERH8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms