Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP0

Lrrc46, Leucine-rich repeat-containing protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc46Q9DAP0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc46Q9DAP0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc46Q9DAP0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc46Q9DAP0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc46Q9DAP0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc46Q9DAP0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc46Q9DAP0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc46Q9DAP0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc46Q9DAP0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc46Q9DAP0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc46Q9DAP0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc46Q9DAP0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc46Q9DAP0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc46Q9DAP0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc46Q9DAP0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc46Q9DAP0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc46Q9DAP0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc46Q9DAP0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc46Q9DAP0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc46Q9DAP0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc46Q9DAP0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc46Q9DAP0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc46Q9DAP0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc46Q9DAP0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc46Q9DAP0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc46Q9DAP0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc46Q9DAP0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc46Q9DAP0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc46Q9DAP0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc46Q9DAP0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lrrc46Q9DAP0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc46Q9DAP0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc46Q9DAP0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc46Q9DAP0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc46Q9DAP0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc46Q9DAP0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc46Q9DAP0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc46Q9DAP0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc46Q9DAP0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc46Q9DAP0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc46Q9DAP0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc46Q9DAP0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc46Q9DAP0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc46Q9DAP0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc46Q9DAP0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc46Q9DAP0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc46Q9DAP0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc46Q9DAP0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc46Q9DAP0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc46Q9DAP0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc46Q9DAP0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc46Q9DAP0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc46Q9DAP0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc46Q9DAP0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc46Q9DAP0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc46Q9DAP0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms