Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PrameQ9D4Z5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrameQ9D4Z5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrameQ9D4Z5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms