Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTRAFQ9CQE8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RTRAFQ9CQE8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.5 ms