Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4921530L21RikQ9CQ47 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4921530L21RikQ9CQ47 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4921530L21RikQ9CQ47 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4921530L21RikQ9CQ47 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4921530L21RikQ9CQ47 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4921530L21RikQ9CQ47 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
4921530L21RikQ9CQ47 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4921530L21RikQ9CQ47 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
4921530L21RikQ9CQ47 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4921530L21RikQ9CQ47 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
4921530L21RikQ9CQ47 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms