Protein–RNA interactions for Protein: Q99L90

Mcrs1, Microspherule protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrs1Q99L90 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mcrs1Q99L90 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcrs1Q99L90 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcrs1Q99L90 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcrs1Q99L90 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcrs1Q99L90 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcrs1Q99L90 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcrs1Q99L90 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcrs1Q99L90 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms