Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg5Q99J83 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg5Q99J83 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg5Q99J83 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg5Q99J83 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg5Q99J83 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg5Q99J83 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg5Q99J83 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg5Q99J83 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg5Q99J83 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg5Q99J83 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg5Q99J83 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg5Q99J83 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg5Q99J83 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg5Q99J83 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg5Q99J83 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg5Q99J83 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg5Q99J83 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg5Q99J83 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg5Q99J83 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg5Q99J83 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg5Q99J83 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg5Q99J83 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg5Q99J83 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg5Q99J83 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg5Q99J83 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg5Q99J83 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg5Q99J83 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg5Q99J83 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg5Q99J83 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg5Q99J83 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg5Q99J83 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg5Q99J83 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg5Q99J83 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg5Q99J83 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms