Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CsprsQ99388 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CsprsQ99388 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CsprsQ99388 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CsprsQ99388 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CsprsQ99388 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CsprsQ99388 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CsprsQ99388 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CsprsQ99388 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CsprsQ99388 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CsprsQ99388 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CsprsQ99388 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CsprsQ99388 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CsprsQ99388 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CsprsQ99388 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CsprsQ99388 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CsprsQ99388 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CsprsQ99388 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CsprsQ99388 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms