Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4C2

Rufy2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy2Q8R4C2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rufy2Q8R4C2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rufy2Q8R4C2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rufy2Q8R4C2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rufy2Q8R4C2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rufy2Q8R4C2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rufy2Q8R4C2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rufy2Q8R4C2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rufy2Q8R4C2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rufy2Q8R4C2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rufy2Q8R4C2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rufy2Q8R4C2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rufy2Q8R4C2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rufy2Q8R4C2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rufy2Q8R4C2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rufy2Q8R4C2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rufy2Q8R4C2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rufy2Q8R4C2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rufy2Q8R4C2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rufy2Q8R4C2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rufy2Q8R4C2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rufy2Q8R4C2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rufy2Q8R4C2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rufy2Q8R4C2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rufy2Q8R4C2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rufy2Q8R4C2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rufy2Q8R4C2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rufy2Q8R4C2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rufy2Q8R4C2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rufy2Q8R4C2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms