Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms