Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV2

Tph2, Tryptophan 5-hydroxylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tph2Q8CGV2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tph2Q8CGV2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tph2Q8CGV2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms