Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms