Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ7

Ltv1, Protein LTV1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltv1Q6NSQ7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltv1Q6NSQ7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ltv1Q6NSQ7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ltv1Q6NSQ7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ltv1Q6NSQ7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms