Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema3cQ62181 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema3cQ62181 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema3cQ62181 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema3cQ62181 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema3cQ62181 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sema3cQ62181 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sema3cQ62181 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema3cQ62181 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms