Protein–RNA interactions for Protein: Q61716

Ifna11, Interferon alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna11Q61716 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifna11Q61716 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms