Protein–RNA interactions for Protein: Q61316

Hspa4, Heat shock 70 kDa protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspa4Q61316 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hspa4Q61316 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hspa4Q61316 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hspa4Q61316 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hspa4Q61316 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hspa4Q61316 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hspa4Q61316 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hspa4Q61316 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hspa4Q61316 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hspa4Q61316 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hspa4Q61316 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hspa4Q61316 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hspa4Q61316 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hspa4Q61316 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hspa4Q61316 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hspa4Q61316 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hspa4Q61316 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hspa4Q61316 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hspa4Q61316 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hspa4Q61316 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hspa4Q61316 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Hspa4Q61316 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hspa4Q61316 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hspa4Q61316 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hspa4Q61316 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hspa4Q61316 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hspa4Q61316 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hspa4Q61316 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hspa4Q61316 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hspa4Q61316 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hspa4Q61316 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hspa4Q61316 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hspa4Q61316 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hspa4Q61316 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hspa4Q61316 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hspa4Q61316 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hspa4Q61316 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hspa4Q61316 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hspa4Q61316 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hspa4Q61316 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hspa4Q61316 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hspa4Q61316 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hspa4Q61316 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hspa4Q61316 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hspa4Q61316 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hspa4Q61316 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hspa4Q61316 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hspa4Q61316 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hspa4Q61316 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hspa4Q61316 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms