Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1C3

Trav3-3, T cell receptor alpha variable 3-3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav3-3Q5R1C3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav3-3Q5R1C3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav3-3Q5R1C3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms