Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Greb1Q3UHK3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Greb1Q3UHK3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms