Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWN3

Cnnm2, Metal transporter CNNM2, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm2Q3TWN3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnnm2Q3TWN3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnnm2Q3TWN3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnnm2Q3TWN3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnnm2Q3TWN3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnnm2Q3TWN3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnnm2Q3TWN3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnnm2Q3TWN3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnnm2Q3TWN3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnnm2Q3TWN3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnnm2Q3TWN3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnnm2Q3TWN3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnnm2Q3TWN3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnnm2Q3TWN3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnnm2Q3TWN3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnnm2Q3TWN3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnnm2Q3TWN3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnnm2Q3TWN3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnnm2Q3TWN3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnnm2Q3TWN3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnnm2Q3TWN3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnnm2Q3TWN3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnnm2Q3TWN3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnnm2Q3TWN3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnnm2Q3TWN3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnnm2Q3TWN3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnnm2Q3TWN3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnnm2Q3TWN3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnnm2Q3TWN3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnnm2Q3TWN3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnnm2Q3TWN3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnnm2Q3TWN3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnnm2Q3TWN3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnnm2Q3TWN3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnnm2Q3TWN3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnnm2Q3TWN3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnnm2Q3TWN3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnnm2Q3TWN3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnnm2Q3TWN3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnnm2Q3TWN3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnnm2Q3TWN3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnnm2Q3TWN3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cnnm2Q3TWN3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cnnm2Q3TWN3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms