Protein–RNA interactions for Protein: Q32NY4

Cnnm3, Metal transporter CNNM3, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm3Q32NY4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnnm3Q32NY4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnnm3Q32NY4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnnm3Q32NY4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnnm3Q32NY4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnnm3Q32NY4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnnm3Q32NY4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnnm3Q32NY4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnnm3Q32NY4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnnm3Q32NY4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnnm3Q32NY4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnnm3Q32NY4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cnnm3Q32NY4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cnnm3Q32NY4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Cnnm3Q32NY4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnnm3Q32NY4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms