Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cpne9Q1RLL3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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