Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 SCW4YGR279C 1161 nt5.34□□□□□ -1.55
LDB17Q12342 YJL068CYJL068C 900 nt5.34□□□□□ -1.55
LDB17Q12342 YKR041WYKR041W 753 nt5.34□□□□□ -1.55
LDB17Q12342 SPG4YMR107W 348 nt5.34□□□□□ -1.55
LDB17Q12342 SLD7YOR060C 774 nt5.34□□□□□ -1.55
LDB17Q12342 HOF1YMR032W 2010 nt5.34□□□□□ -1.55
LDB17Q12342 HXT5YHR096C 1779 nt5.34□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 MPP10YJR002W 1782 nt5.34□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 NRD1YNL251C 1728 nt5.34□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 GUS1YGL245W 2127 nt5.33□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 SSY5YJL156C 2100 nt5.33□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 ATG20YDL113C 1923 nt5.33□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 VHS1YDR247W 1386 nt5.33□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 DFG5YMR238W 1377 nt5.33□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 ARP2YDL029W 1176 nt5.33□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 MLC1YGL106W 450 nt5.33□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 PRS1YKL181W 1284 nt5.33□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 RPA49YNL248C 1248 nt5.33□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 LEM3YNL323W 1245 nt5.33□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 NPT1YOR209C 1290 nt5.33□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 CNM67YNL225C 1746 nt5.33□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 GDB1YPR184W 4611 nt5.33□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 RPL12AYEL054C 498 nt5.32□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 YPT32YGL210W 669 nt5.32□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 CSM2YIL132C 642 nt5.32□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.32□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 KTR3YBR205W 1215 nt5.32□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 HAP1YLR256W 4509 nt5.32□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 YGR139WYGR139W 339 nt5.31□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 YKL151CYKL151C 1014 nt5.31□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 MRPL13YKR006C 795 nt5.31□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 REC114YMR133W 1287 nt5.31□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 KIP2YPL155C 2121 nt5.31□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 FOL1YNL256W 2475 nt5.31□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 YMD8YML038C 1329 nt5.3□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 BRF1YGR246C 1791 nt5.3□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 ATG18YFR021W 1503 nt5.3□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 TRP1YDR007W 675 nt5.3□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 SLO1YER180C-A 258 nt5.3□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 RPT6YGL048C 1218 nt5.3□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 MTW1YAL034W-A 870 nt5.3□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 POM33YLL023C 840 nt5.3□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 DPH2YKL191W 1605 nt5.3□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 PMA1YGL008C 2757 nt5.29□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 DBF2YGR092W 1719 nt5.29□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 RAD53YPL153C 2466 nt5.29□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 IPK1YDR315C 846 nt5.29□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 YGR182CYGR182C 354 nt5.29□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 YOR024WYOR024W 324 nt5.29□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 SCO1YBR037C 888 nt5.29□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 FRE3YOR381W 2136 nt5.29□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 URA7YBL039C 1740 nt5.28□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 KNH1YDL049C 807 nt5.28□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 SNF11YDR073W 510 nt5.28□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 RER2YBR002C 861 nt5.28□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 GAL10YBR019C 2100 nt5.28□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 YOR318CYOR318C 306 nt5.28□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 snR32snR32 188 nt5.28□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 DAK1YML070W 1755 nt5.28□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 GAS3YMR215W 1575 nt5.28□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 RIM15YFL033C 5313 nt5.28□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 RRN3YKL125W 1884 nt5.28□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 NOB1YOR056C 1380 nt5.28□□□□□ -1.56
LDB17Q12342 TEA1YOR337W 2280 nt5.27□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 SLT2YHR030C 1455 nt5.27□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 GET3YDL100C 1065 nt5.27□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 ADK2YER170W 678 nt5.27□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 PHO86YJL117W 936 nt5.27□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 YJL211CYJL211C 444 nt5.27□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 CBF1YJR060W 1056 nt5.27□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 PRP45YAL032C 1140 nt5.27□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt5.27□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 NRM1YNR009W 750 nt5.27□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 CAR1YPL111W 1002 nt5.27□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 ATE1YGL017W 1512 nt5.27□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 ARB1YER036C 1833 nt5.26□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 RPS16BYDL083C 432 nt5.26□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt5.26□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 PHM8YER037W 966 nt5.26□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt5.26□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 DAL3YIR032C 588 nt5.26□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 CKA2YOR061W 1020 nt5.26□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 ETR1YBR026C 1143 nt5.26□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 RPL21BYPL079W 483 nt5.26□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 SAM4YPL273W 978 nt5.26□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 GLT1YDL171C 6438 nt5.26□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 DBF4YDR052C 2115 nt5.26□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 YOR1YGR281W 4434 nt5.26□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 APM4YOL062C 1476 nt5.26□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 COQ6YGR255C 1440 nt5.25□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 NGL2YMR285C 1548 nt5.25□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 UTR4YEL038W 684 nt5.25□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 BUD14YAR014C 2130 nt5.25□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 DCC1YCL016C 1143 nt5.25□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 BIT2YBR270C 1638 nt5.25□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 AVT3YKL146W 2079 nt5.25□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 ARN2YHL047C 1863 nt5.24□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 DNF2YDR093W 4839 nt5.24□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 PRO3YER023W 861 nt5.24□□□□□ -1.57
LDB17Q12342 SUA5YGL169W 1281 nt5.24□□□□□ -1.57
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