Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC173Q0VFZ6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC173Q0VFZ6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms