Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gata4Q08369 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gata4Q08369 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms