Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RelbQ04863 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RelbQ04863 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RelbQ04863 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RelbQ04863 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms