Protein–RNA interactions for Protein: Q02199

NUP49, Nucleoporin NUP49/NSP49, yeastyeast

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP49Q02199 CBP4YGR174C 513 nt4.83□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 SNN1YNL086W 309 nt4.83□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 MRPL22YNL177C 930 nt4.83□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 RPL21BYPL079W 483 nt4.83□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 MRPL36YBR122C 534 nt4.83□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 PMT2YAL023C 2280 nt4.83□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 TPS3YMR261C 3165 nt4.82□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 GDB1YPR184W 4611 nt4.82□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 YDL119CYDL119C 924 nt4.82□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 MHF2YDL160C-A 243 nt4.82□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 HSX1tR(CCU)J 72 nt4.82□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 SSP120YLR250W 705 nt4.82□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt4.82□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 ECM33YBR078W 1290 nt4.82□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 ELP2YGR200C 2367 nt4.82□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 ARN2YHL047C 1863 nt4.81□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 ERD1YDR414C 1089 nt4.81□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 PRP45YAL032C 1140 nt4.81□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 MRP17YKL003C 396 nt4.81□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 SFK1YKL051W 1062 nt4.81□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 YML131WYML131W 1098 nt4.81□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt4.81□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 RSC6YCR052W 1452 nt4.81□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt4.8□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 UTR4YEL038W 684 nt4.8□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 DBP8YHR169W 1296 nt4.8□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 EGD2YHR193C 525 nt4.8□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 YLL059CYLL059C 507 nt4.8□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 AVO2YMR068W 1281 nt4.8□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 YPL062WYPL062W 405 nt4.8□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 NTH2YBR001C 2343 nt4.79□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 CDC19YAL038W 1503 nt4.79□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 BRE2YLR015W 1518 nt4.79□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 CAD1YDR423C 1230 nt4.79□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 DCN1YLR128W 810 nt4.79□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 TFS1YLR178C 660 nt4.79□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 TOS4YLR183C 1470 nt4.79□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 DRS1YLL008W 2259 nt4.79□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 PRR1YKL116C 1557 nt4.78□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 AUA1YFL010W-A 285 nt4.78□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 COS9YKL219W 1224 nt4.78□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 SOL1YNR034W 966 nt4.78□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt4.78□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 HXT14YNL318C 1623 nt4.78□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 CDC4YFL009W 2340 nt4.78□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 YDR401WYDR401W 564 nt4.77□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 DCC1YCL016C 1143 nt4.77□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 YJL206CYJL206C 2277 nt4.77□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 UBA2YDR390C 1911 nt4.77□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 IES1YFL013C 2079 nt4.77□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 SOG2YOR353C 2376 nt4.77□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 YGL185CYGL185C 1140 nt4.76□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 YPT32YGL210W 669 nt4.76□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 JJJ3YJR097W 519 nt4.76□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt4.76□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 ETT1YOR051C 1239 nt4.76□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 QCR2YPR191W 1107 nt4.76□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 RCK1YGL158W 1539 nt4.76□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 IMA1YGR287C 1770 nt4.76□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 SCW4YGR279C 1161 nt4.75□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 SPL2YHR136C 447 nt4.75□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt4.75□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 DAL82YNL314W 768 nt4.75□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 CKA2YOR061W 1020 nt4.75□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 snR17bsnR17b 332 nt4.75□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 FHL1YPR104C 2811 nt4.75□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 RTT106YNL206C 1368 nt4.75□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 KCH1YJR054W 1494 nt4.75□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 GAS3YMR215W 1575 nt4.74□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 GRX4YER174C 735 nt4.74□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 NAG1YGR031C-A 492 nt4.74□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 DBF2YGR092W 1719 nt4.74□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 SNF3YDL194W 2655 nt4.74□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 NOP7YGR103W 1818 nt4.74□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 MTF2YDL044C 1323 nt4.73□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 GIR2YDR152W 798 nt4.73□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 KTI12YKL110C 942 nt4.73□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 YOR200WYOR200W 399 nt4.73□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 MET31YPL038W 534 nt4.73□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 MRI1YPR118W 1236 nt4.73□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 GAL10YBR019C 2100 nt4.73□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 ECM7YLR443W 1347 nt4.72□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 YMD8YML038C 1329 nt4.72□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 ADE4YMR300C 1533 nt4.72□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 ROT2YBR229C 2865 nt4.72□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 BLM10YFL007W 6432 nt4.72□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 SLC1YDL052C 912 nt4.72□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 AXL2YIL140W 2472 nt4.72□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 YNL247WYNL247W 2304 nt4.72□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 WTM2YOR229W 1404 nt4.72□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 DNF2YDR093W 4839 nt4.71□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 AFT1YGL071W 2073 nt4.71□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 AVT3YKL146W 2079 nt4.71□□□□□ -1.65
NUP49Q02199 ENP1YBR247C 1452 nt4.71□□□□□ -1.66
NUP49Q02199 AIM17YHL021C 1398 nt4.71□□□□□ -1.66
NUP49Q02199 TUP1YCR084C 2142 nt4.71□□□□□ -1.66
NUP49Q02199 SYF2YGR129W 648 nt4.71□□□□□ -1.66
NUP49Q02199 YJR115WYJR115W 510 nt4.71□□□□□ -1.66
NUP49Q02199 PGU1YJR153W 1086 nt4.71□□□□□ -1.66
NUP49Q02199 SEC39YLR440C 2130 nt4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36.9 ms