Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sec23aQ01405 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sec23aQ01405 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sec23aQ01405 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sec23aQ01405 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sec23aQ01405 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sec23aQ01405 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms