Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PrcdQ00LT2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1350.2 ms