Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IhhP97812 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IhhP97812 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IhhP97812 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IhhP97812 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
IhhP97812 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IhhP97812 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
IhhP97812 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IhhP97812 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IhhP97812 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IhhP97812 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IhhP97812 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IhhP97812 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IhhP97812 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IhhP97812 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IhhP97812 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IhhP97812 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IhhP97812 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IhhP97812 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IhhP97812 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IhhP97812 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IhhP97812 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
IhhP97812 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IhhP97812 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IhhP97812 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
IhhP97812 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
IhhP97812 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IhhP97812 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IhhP97812 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IhhP97812 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IhhP97812 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IhhP97812 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IhhP97812 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IhhP97812 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IhhP97812 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IhhP97812 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IhhP97812 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IhhP97812 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IhhP97812 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IhhP97812 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
IhhP97812 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IhhP97812 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IhhP97812 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IhhP97812 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IhhP97812 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IhhP97812 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IhhP97812 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IhhP97812 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IhhP97812 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IhhP97812 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IhhP97812 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
IhhP97812 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IhhP97812 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IhhP97812 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IhhP97812 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IhhP97812 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IhhP97812 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IhhP97812 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IhhP97812 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IhhP97812 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IhhP97812 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IhhP97812 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IhhP97812 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IhhP97812 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IhhP97812 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IhhP97812 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IhhP97812 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IhhP97812 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IhhP97812 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IhhP97812 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
IhhP97812 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IhhP97812 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IhhP97812 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IhhP97812 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IhhP97812 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IhhP97812 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IhhP97812 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IhhP97812 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IhhP97812 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IhhP97812 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IhhP97812 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IhhP97812 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IhhP97812 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IhhP97812 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IhhP97812 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IhhP97812 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IhhP97812 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IhhP97812 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IhhP97812 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IhhP97812 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IhhP97812 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IhhP97812 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IhhP97812 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IhhP97812 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IhhP97812 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IhhP97812 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IhhP97812 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IhhP97812 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IhhP97812 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IhhP97812 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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