Protein–RNA interactions for Protein: P86050

Tmem170b, Transmembrane protein 170B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem170bP86050 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem170bP86050 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem170bP86050 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem170bP86050 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem170bP86050 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem170bP86050 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem170bP86050 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem170bP86050 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem170bP86050 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem170bP86050 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem170bP86050 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem170bP86050 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem170bP86050 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem170bP86050 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem170bP86050 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem170bP86050 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem170bP86050 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem170bP86050 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem170bP86050 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem170bP86050 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem170bP86050 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem170bP86050 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem170bP86050 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem170bP86050 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem170bP86050 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem170bP86050 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem170bP86050 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem170bP86050 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem170bP86050 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem170bP86050 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem170bP86050 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem170bP86050 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem170bP86050 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem170bP86050 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem170bP86050 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem170bP86050 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem170bP86050 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem170bP86050 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem170bP86050 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem170bP86050 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmem170bP86050 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem170bP86050 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem170bP86050 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem170bP86050 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem170bP86050 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem170bP86050 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem170bP86050 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem170bP86050 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem170bP86050 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem170bP86050 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem170bP86050 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem170bP86050 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem170bP86050 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem170bP86050 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem170bP86050 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem170bP86050 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem170bP86050 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem170bP86050 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem170bP86050 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem170bP86050 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem170bP86050 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem170bP86050 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms