Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhobP62746 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhobP62746 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhobP62746 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhobP62746 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhobP62746 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhobP62746 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhobP62746 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhobP62746 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RhobP62746 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhobP62746 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhobP62746 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhobP62746 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhobP62746 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhobP62746 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhobP62746 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhobP62746 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhobP62746 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhobP62746 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhobP62746 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhobP62746 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhobP62746 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhobP62746 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhobP62746 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhobP62746 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhobP62746 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhobP62746 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhobP62746 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhobP62746 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhobP62746 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhobP62746 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhobP62746 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhobP62746 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhobP62746 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhobP62746 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RhobP62746 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhobP62746 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhobP62746 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhobP62746 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhobP62746 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhobP62746 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhobP62746 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RhobP62746 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhobP62746 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhobP62746 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RhobP62746 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RhobP62746 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhobP62746 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhobP62746 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhobP62746 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhobP62746 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RhobP62746 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhobP62746 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhobP62746 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhobP62746 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhobP62746 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhobP62746 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhobP62746 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhobP62746 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhobP62746 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhobP62746 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhobP62746 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RhobP62746 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhobP62746 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhobP62746 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhobP62746 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhobP62746 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhobP62746 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhobP62746 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhobP62746 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RhobP62746 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhobP62746 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhobP62746 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhobP62746 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhobP62746 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhobP62746 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhobP62746 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhobP62746 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhobP62746 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhobP62746 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RhobP62746 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhobP62746 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhobP62746 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhobP62746 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RhobP62746 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RhobP62746 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhobP62746 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhobP62746 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhobP62746 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RhobP62746 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RhobP62746 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhobP62746 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RhobP62746 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhobP62746 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhobP62746 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhobP62746 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhobP62746 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhobP62746 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhobP62746 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RhobP62746 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms