Protein–RNA interactions for Protein: P62196

Psmc5, 26S proteasome regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc5P62196 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmc5P62196 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmc5P62196 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmc5P62196 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmc5P62196 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmc5P62196 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmc5P62196 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmc5P62196 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmc5P62196 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmc5P62196 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmc5P62196 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmc5P62196 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmc5P62196 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmc5P62196 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmc5P62196 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmc5P62196 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmc5P62196 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmc5P62196 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmc5P62196 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmc5P62196 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmc5P62196 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmc5P62196 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmc5P62196 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmc5P62196 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmc5P62196 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmc5P62196 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmc5P62196 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmc5P62196 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmc5P62196 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmc5P62196 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmc5P62196 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmc5P62196 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmc5P62196 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmc5P62196 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmc5P62196 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmc5P62196 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms