Protein–RNA interactions for Protein: P58771

Tpm1, Tropomyosin alpha-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm1P58771 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tpm1P58771 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpm1P58771 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms