Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apobec1P51908 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apobec1P51908 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apobec1P51908 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apobec1P51908 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apobec1P51908 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apobec1P51908 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apobec1P51908 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apobec1P51908 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apobec1P51908 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apobec1P51908 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Apobec1P51908 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apobec1P51908 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apobec1P51908 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apobec1P51908 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apobec1P51908 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apobec1P51908 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apobec1P51908 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apobec1P51908 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apobec1P51908 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apobec1P51908 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apobec1P51908 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apobec1P51908 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apobec1P51908 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apobec1P51908 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apobec1P51908 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apobec1P51908 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apobec1P51908 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apobec1P51908 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apobec1P51908 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apobec1P51908 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apobec1P51908 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apobec1P51908 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apobec1P51908 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apobec1P51908 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apobec1P51908 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms