Protein–RNA interactions for Protein: P40462

TMA108, Protein TMA108, yeast

Predictions only

Length 946 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TMA108	P40462	URA3	YEL021W	804 nt		5.79	□□□□□ -1.48
TMA108	P40462	CBP4	YGR174C	513 nt		5.79	□□□□□ -1.48
TMA108	P40462	SFC1	YJR095W	969 nt		5.79	□□□□□ -1.48
TMA108	P40462	ARR3	YPR201W	1215 nt		5.79	□□□□□ -1.48
TMA108	P40462	KTR5	YNL029C	1569 nt		5.79	□□□□□ -1.48
TMA108	P40462	SDA1	YGR245C	2304 nt		5.79	□□□□□ -1.48
TMA108	P40462	BUL1	YMR275C	2931 nt		5.78	□□□□□ -1.48
TMA108	P40462	VHT1	YGR065C	1782 nt		5.78	□□□□□ -1.48
TMA108	P40462	STL1	YDR536W	1710 nt		5.78	□□□□□ -1.48
TMA108	P40462	SIP2	YGL208W	1248 nt		5.78	□□□□□ -1.48
TMA108	P40462	YGR011W	YGR011W	327 nt		5.78	□□□□□ -1.48
TMA108	P40462	DCN1	YLR128W	810 nt		5.78	□□□□□ -1.48
TMA108	P40462	YMR086C-A	YMR086C-A	339 nt		5.78	□□□□□ -1.48
TMA108	P40462	ATG32	YIL146C	1590 nt		5.77	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	MEC3	YLR288C	1425 nt		5.77	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	IMG2	YCR071C	441 nt		5.77	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	ECM1	YAL059W	639 nt		5.77	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	SPS18	YNL204C	903 nt		5.77	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	PDR16	YNL231C	1056 nt		5.77	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	CAR1	YPL111W	1002 nt		5.77	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	FLC3	YGL139W	2409 nt		5.77	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	QNS1	YHR074W	2145 nt		5.77	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	GSH2	YOL049W	1476 nt		5.77	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	ALT1	YLR089C	1779 nt		5.76	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	ALD6	YPL061W	1503 nt		5.76	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	YDL121C	YDL121C	450 nt		5.76	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	DON1	YDR273W	1098 nt		5.76	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	YKR104W	YKR104W	921 nt		5.76	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	MRPL36	YBR122C	534 nt		5.76	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	YBR230W-A	YBR230W-A	201 nt		5.76	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	SMP1	YBR182C	1359 nt		5.76	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	IXR1	YKL032C	1794 nt		5.75	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	MET3	YJR010W	1536 nt		5.75	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	SPO74	YGL170C	1242 nt		5.75	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	HSX1	tR(CCU)J	72 nt		5.75	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	TEF1	YPR080W	1377 nt		5.75	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	TEF2	YBR118W	1377 nt		5.75	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	VBA1	YMR088C	1689 nt		5.75	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	CLD1	YGR110W	1338 nt		5.74	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	ADY2	YCR010C	852 nt		5.74	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	YER134C	YER134C	537 nt		5.74	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	YIL028W	YIL028W	399 nt		5.74	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	PSH1	YOL054W	1221 nt		5.74	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	SUE1	YPR151C	621 nt		5.74	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	RRT2	YBR246W	1164 nt		5.74	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	DFG5	YMR238W	1377 nt		5.74	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	TRK2	YKR050W	2670 nt		5.74	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	ARB1	YER036C	1833 nt		5.74	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	DXO1	YDR370C	1329 nt		5.74	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	YDL034W	YDL034W	345 nt		5.73	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	MMS21	YEL019C	804 nt		5.73	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	PGA3	YML125C	939 nt		5.73	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	CBP1	YJL209W	1965 nt		5.73	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	YTA12	YMR089C	2478 nt		5.72	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	BAP2	YBR068C	1830 nt		5.72	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	VHS1	YDR247W	1386 nt		5.72	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	RHB1	YCR027C	630 nt		5.72	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	EFM4	YIL064W	774 nt		5.72	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	PAU17	YLL025W	375 nt		5.72	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	STE13	YOR219C	2796 nt		5.72	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	SHE10	YGL228W	1734 nt		5.71	□□□□□ -1.49
TMA108	P40462	YIL067C	YIL067C	2037 nt		5.71	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	HXT5	YHR096C	1779 nt		5.71	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	tN(GUU)C	tN(GUU)C	74 nt		5.71	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	tN(GUU)F	tN(GUU)F	74 nt		5.71	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	tN(GUU)G	tN(GUU)G	74 nt		5.71	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	tN(GUU)K	tN(GUU)K	74 nt		5.71	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	tN(GUU)L	tN(GUU)L	74 nt		5.71	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	tN(GUU)N1	tN(GUU)N1	74 nt		5.71	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	tN(GUU)N2	tN(GUU)N2	74 nt		5.71	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	tN(GUU)O1	tN(GUU)O1	74 nt		5.71	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	tN(GUU)O2	tN(GUU)O2	74 nt		5.71	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	tN(GUU)P	tN(GUU)P	74 nt		5.71	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	YJL107C	YJL107C	1164 nt		5.71	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	RHO2	YNL090W	579 nt		5.71	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	ARG1	YOL058W	1263 nt		5.71	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	ARG8	YOL140W	1272 nt		5.71	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	PIN2	YOR104W	849 nt		5.71	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	TBF1	YPL128C	1689 nt		5.71	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	YCR097W-A	YCR097W-A	267 nt		5.7	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	CAD1	YDR423C	1230 nt		5.7	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	YFR052C-A	YFR052C-A	306 nt		5.7	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	YLL059C	YLL059C	507 nt		5.7	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	YBL029W	YBL029W	1131 nt		5.7	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	snR3	snR3	194 nt		5.7	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	SPO77	YLR341W	1434 nt		5.7	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	IBA57	YJR122W	1494 nt		5.7	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	CAB4	YGR277C	918 nt		5.69	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	MAD2	YJL030W	591 nt		5.69	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	YOR289W	YOR289W	756 nt		5.69	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	RKM4	YDR257C	1485 nt		5.69	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	UTP7	YER082C	1665 nt		5.69	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	RNR3	YIL066C	2610 nt		5.68	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	UTP18	YJL069C	1785 nt		5.68	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	COX26	YDR119W-A	201 nt		5.68	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	GIR2	YDR152W	798 nt		5.68	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	GLE2	YER107C	1098 nt		5.68	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	ARR1	YPR199C	885 nt		5.68	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	ECM3	YOR092W	1842 nt		5.68	□□□□□ -1.5
TMA108	P40462	PCL8	YPL219W	1479 nt		5.67	□□□□□ -1.5

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