Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gjb3P28231 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb3P28231 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb3P28231 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb3P28231 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb3P28231 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb3P28231 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb3P28231 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb3P28231 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb3P28231 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb3P28231 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb3P28231 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb3P28231 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb3P28231 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb3P28231 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb3P28231 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb3P28231 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb3P28231 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb3P28231 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb3P28231 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb3P28231 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb3P28231 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb3P28231 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gjb3P28231 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gjb3P28231 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gjb3P28231 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gjb3P28231 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb3P28231 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb3P28231 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb3P28231 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb3P28231 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb3P28231 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb3P28231 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb3P28231 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms