Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-DMaP28078 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-DMaP28078 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms