Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd247P24161 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd247P24161 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd247P24161 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd247P24161 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd247P24161 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cd247P24161 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd247P24161 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd247P24161 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd247P24161 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd247P24161 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd247P24161 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd247P24161 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd247P24161 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd247P24161 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd247P24161 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd247P24161 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd247P24161 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd247P24161 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd247P24161 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd247P24161 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd247P24161 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd247P24161 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd247P24161 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd247P24161 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd247P24161 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd247P24161 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd247P24161 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd247P24161 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd247P24161 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd247P24161 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd247P24161 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd247P24161 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd247P24161 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd247P24161 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd247P24161 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd247P24161 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd247P24161 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd247P24161 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd247P24161 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd247P24161 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd247P24161 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cd247P24161 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd247P24161 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd247P24161 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd247P24161 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd247P24161 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms