Protein–RNA interactions for Protein: P21440

Abcb4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb4P21440 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcb4P21440 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms