Protein–RNA interactions for Protein: P21278

Gna11, Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gna11P21278 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gna11P21278 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gna11P21278 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gna11P21278 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Gna11P21278 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gna11P21278 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gna11P21278 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Gna11P21278 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gna11P21278 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gna11P21278 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gna11P21278 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gna11P21278 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gna11P21278 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gna11P21278 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gna11P21278 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gna11P21278 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gna11P21278 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gna11P21278 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gna11P21278 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gna11P21278 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gna11P21278 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gna11P21278 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gna11P21278 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gna11P21278 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gna11P21278 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gna11P21278 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gna11P21278 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gna11P21278 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gna11P21278 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gna11P21278 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gna11P21278 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gna11P21278 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms