Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC4P09017 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC4P09017 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms