Protein–RNA interactions for Protein: P06837

Gap43, Neuromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gap43P06837 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gap43P06837 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gap43P06837 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gap43P06837 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gap43P06837 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gap43P06837 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gap43P06837 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gap43P06837 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gap43P06837 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gap43P06837 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gap43P06837 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gap43P06837 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gap43P06837 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms